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課程名稱 |
系統代謝學
SYSTEMS ANALYSIS ON METABOLOMICS |
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開課學期 |
97-2 |
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授課對象 |
電機資訊學院 生醫電子與資訊學研究所 |
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授課教師 |
曾宇鳳 |
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課號 |
CSIE5153 |
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課程識別碼 |
922EU3820 |
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班次 |
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學分 |
3 |
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全/半年 |
半年 |
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必/選修 |
選修 |
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上課時間 |
星期二5,6,7(12:20~15:10) |
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上課地點 |
資111 |
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備註 |
本課程以英語授課。與郭錦樺合開
限學士班四年級以上
總人數上限：20人 |
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Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/972SysMeta |
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課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
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課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
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課程目標 |
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課程要求 |
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預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
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指定閱讀 |
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參考書目 |
1. Seetharaman Vaidyanathan and George G. Harrigan, 2005, Metabolome analyses:
Strategies for system biology, Springer Science. (
http://www.springerlink.com/content/jp01qx/ )
2. Howard Mark and Jerry Workman, Jr., 2007, Chemometrics in Spectroscopy,
Academic Press
3. M. Tomita and T. Nishioka, Metabolomics: The Frontier of Systems Biology,
Springer Tokyo, 2005 ( http://www.springerlink.com/content/nh7w77/ )
4. William J. Griffiths, Metabolomics, Metabonomics and Metabolite Profiling,
Baker & Taylor, 2008
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評量方式
(僅供參考) |
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No. |
項目 |
百分比 |
說明 |
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1. |
Paper presentation |
50% |
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2. |
exam |
50% |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
02/17 |
Introduction to chemometrics/Metabolomics |
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第2週 |
2/24 |
HPLC for metabolomics |
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第3週 |
03/03 |
Nonsupervised Construction and Application of Mass Spectral and Retention Time Index Libraries From Time-of-Flight Gas Chromatography-Mass Spectrometry Metabolite Profiles |
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第4週 |
03/10 |
Mass spectrometry for metabolite identification |
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第5週 |
03/17 |
Integrative Profiling of Metabolites and Proteins
Improving Pattern Recognition and Biomarker Selection for Systems Level Approaches
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第6週 |
03/24 |
Metabolite profiling of human urine with capillary GC/MS |
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第7週 |
03/31 |
Integrating Profiling Data
Using Linear Correlation to Reveal Coregulation of Transcript and Metabolites
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第8週 |
04/07 |
Capillary electrophoresis and its application in metabolome analysis |
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第9週 |
04/14 |
期中考 |
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第10週 |
04/21 |
Visualization and Analysis of Molecular Data |
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第11週 |
04/28 |
NMR |
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第12週 |
05/05 |
A Gentle Guide to the Analysis of Metabolomic Data |
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第13週 |
05/12 |
NMR based metabonomics in toxicology research |
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第14週 |
05/19 |
Understanding the Roadmap of Metabolism by Pathway Analysis |
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第15週 |
05/26 |
Analytical methods from the prespective of method standardization |
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第16週 |
06/02 |
Metabolics networks |
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第17週 |
06/09 |
Final exam |
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